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粪便预测大肠癌
点击次数:404 发布时间:2015-10-19
 

根据一项新的调查研究显示,通过分析大肠癌患者病灶附近的微生物组群相比于传统的血液检测有很多的优点:灵敏度与特异性都要更高,而且无创。

“大肠癌患者体内的微生物组群构成一定会有相应的改变,因为不同的基因突变可能会造成不同的癌症类型,这些肿瘤也会对周围的微生物组造成一定的影响"。来自民尼苏达大学的Ran Blekhman博士说到。

该研究结果发表在2015年美国人类遗传协会的会议上。

在该研究中,Blekhman与同事们比较了正常大肠细胞与大肠癌肿瘤细胞间的遗传差异,他们发现特定的肿瘤相关基因突变与特异性的大肠寄生细菌有很大关系。  

例如,具有APC基因突变的人群易得腺瘤肉病(一类遗传性的癌症),同时他们体内肿瘤组织附近具有大量的梭杆菌。Blekhman博士指出他们实验室*次分析了这种肿瘤相关突变与肿瘤周围微生物组之间的关系。

研究者们通过全基因外显子测序的手段分析了肿瘤组织周围(或者对照正常组织周围)的微生物组的组成。不同的突变往往与特定微生物类型种群丰度有相关性。另外,同一样品内部如果遗传突变越多,其周围鉴定出的微生物种群类型也就越多。

通过突变手段,作者们发现如果肿瘤细胞内葡萄糖转运通路被阻断的话,微生物群所需的能量消耗也就越多。这说明在某些情况下肿瘤与周围的微生物在竞争性地使用体内的资源。

之后,研究者们以微生物的种类与丰度为标准评估了一些肿瘤相关遗传突变。这一结果能够准确预测ZFN717基因的突变。该基因能够编码锌指核酸酶用于DNA的修复。该结果也表明我们可以通过分析患者粪便中的微生物成分大致预测肿瘤的类型,而且理论上也可以通过控制肿瘤微环境预防、治疗癌Dami    巨核细胞    
SPC-A-1    肺腺癌    
CHMas    肥大细胞白血病    
SGC-7901    胃腺癌    
HEL    红细胞白血病 (Erythroleukemia)    
BGC-823    低分化胃腺癌    
HL-60    原髓细胞白血病 (Promyelocytic lenukemia)    
LoVo    结肠腺癌    
Hut-78    皮肤T细胞淋巴瘤    
Ls-174-T    结肠腺癌    
Hut-102    皮肤T细胞淋巴瘤    
HCT-8    回盲肠腺癌    
Namalwa    Burkitt`s淋巴瘤    
HCe-8693    盲肠未分化腺癌    
Jurknt. klone E6-1    白血病细胞    
HR-8348    直肠腺癌    
THP-1    单核细胞    
BEL-7402    肝癌    
U937    组织细胞淋巴瘤    
BEL-7404    肝癌    
Raji    Burkitt's淋巴瘤    
BEL-7405    肝癌    
MEG-01    成巨核细胞白血病    
HepG2    肝细胞癌    
L129    NCTC克隆929    
L-M TK    鼠胸腺激酶缺陷细胞株    
STO    鼠胚成纤维细胞系    
YAC-1    鼠T淋巴瘤细胞系    
MA-782    鼠乳腺癌细胞系    
GR    鼠成纤维细胞系    
NIH/3T3    鼠成纤维细胞系    
B16-Fo    鼠黑色素瘤细胞系    
B16-F1    鼠黑色素瘤细胞系    

 

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